企业办理EDI许可证需要经过以下的流程：

一、企业需要到当地的通信管理部门的对应窗口，进行EDI许可证办理材料的提交；

二、如果企业自身满足申请条件，并且提交的材料没有缺漏，完整和真实性可以保证，符合相应的法律法规和法定形式，那么办理窗口的工作人员就会受理这个办理申请，如果材料不全，企业条件不够，那么这份申请就会被退回，然后会向申报企业说明不受理的原因；

三、通信管理部门会对这些提交的材料进行再度审核，审核通过之后会通知给企业，然后发放给企业EDI许可证的证明。

EDI许可证的有效期为五年，而且每年都需要参加年检，企业要合法经营，不可以出现违规事故，EDI许可证侧重是在于对数据的处理，也就是消费者在企业建设的网站上进行购物支付的时候，对于业务信息还有支付信息这部分的处理，企业想要在网购市场上争取到一份天地，那么就需要及时进行相关凭证的办理。